Como debería tratar en una niña de tres años la separación de sus padres?

Claramente te preocupa el tema de modo que consultar con un especialista será lo adecuado.
Exitos

Hola!
Debes acudir a un tratamiento psicologico para trabajar la separacion de padres. Es una situacion dificil que requiere de acompañamiento terapeutico y familiar.
Saludos.

Te sugiero en primer instancia charlarlo con su pediatra quien lleva la historia clínica de la niña y la observa en las consultas quien sabrá evaluar si hay cambios en ella con la separación, hablar en su jardin de infantes con las maestras para que puedan estar al tanto y en contacto contigo si observan algo significativo y hablar mucho con la niña, es de suma importancia que ella sienta que los padres se han separado pero no los ha perdido, que sienta que es querida por ambos. Si notas que no puedes con esta situación, te sugiero consultar con un especialista en niños y asesoramiento a padres. Cualquier consulta estoy a tu disposición. Saludos.

Hola me especializo en parejas y familias. Es bueno saber que no subestimes la capacidad de percepción de niños a esa edad. Por lo tanto el proceso de separación debe ser acompañado terapéutica mente, para minimizar el impacto.
El niño en particular en ese grupo etario se manifiesta en "lo que le pasa" a través de conductas y comportamientos.

Hola es importante hablar con la niña y tratar de explicarle lo que está pasando entre los padres. Sería conveniente que comiences un tratamiento psicológico, este te ayudará a tener herramientas para transmitirle a tu hija algo de lo que está pasando entre uds.

Es aconsejable para cada edad decir la verdad de lo que sucede en la familia adecuándolo a su nivel de comprensión pero es importante que la niña sepa lo que esta sucediendo por lo tanto creo que comunicárselo con su lenguaje es lo mas sensato. El modo de transmitirlo es importante por lo cual hay que controlar la carga emocional al comunicarlo...

Sugiero que realices una consulta a un psicólogo que trabaje con "orientación a padres" o "orientación familiar". El profesional, conociendo las particularidades del caso, no sólo va a poder apoyarlos psicológicamente en el proceso, sino que también van a poder abordar cómo manejarlo con la niña: desde la comunicación de la decisión parental, hasta ayudarla a adaptarse a los cambios, a comprender la situación y a expresar sus sentimientos....
La separación es una situación de cambios que afecta a todos emocionalmente y es importante acompañarla desde un espacio terapéutico!
Saludos!

Estoy totalmente de acuerdo con la Lic. Melisa Miravet.
la niña aún es pequeña pero puede perfectamente percibir los cambios a su alrededor. en los casos de divorcios o separaciones se suele trabajar mucho en orientación a padres ya que va en mucho como ellos estén llevando la situación que de por si es difícil para todos los miembros de la familia.
Saludos